他想派一个心腹去任副团长，试图让这支部队摆脱张振武控制，遭到该团的拒绝。
他又下令将这个团编入其亲信王安澜统率的第六镇，又遭强烈反对，被迫收回成命。
最后又设计想把该团改为军官学校，也没能成功。
民国成立后，南北方不打仗了，都开始裁撤军队。原兵站所辖六个大队，共千余人，黎元洪下令将其解散。
张振武则把这支队伍改编成军务司护卫队，又成了他亲手掌握的一支部队。这样的在黎元洪身边拥兵自重，让黎元洪如何能泰然处之。
更何况，张振武对黎元洪的施政有诸多不满，还经常把“鄂政不良，我等当再度革命”也挂在嘴上。
在两个人之间，还有一件怨恨很深之事。南北议和期间，为了做打的准备，张振武曾带巨款去沪购置军火。
湖北驻沪代表杨玉如电告黎元洪，说张振武“耗费公款，械不合用”。
黎元洪派人去查他的账目，并电请沪都督陈其美监视他的活动。
张振武一怒之下返鄂，当面质问黎元洪“你凭什么资格查我的帐？”
黎元洪实行军民分治，将武昌起义有功人员，警视厅长顾庆云排挤去职。张振武非常气愤，上书黎元洪严词诘责，使黎元洪觉得张振武是处处和自己作对。
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