作为一个教练，他的执教成绩也是不错的。尤其是前期。
他刚刚接手马德里竞技，就率队拿到了洲际杯冠军，随后在197677赛季为马德里竞技拿到了西甲冠军。当时马德里竞技总共才拿了八个西甲联赛冠军，阿拉贡内斯在球员时代加教练时代，就给马德里竞技拿了四个。占了球队冠军总数的一半。可以说马德里竞技能够成为西班牙国内第三大的球队，阿拉贡内斯的贡献是很大的。
所以直到现在，马德里竞技的球迷都很喜欢他，而他自己也一直将马德里竞技视为自己最钟爱的球队。
有一件事情或许可以证明这一点。
就在接下来的一个赛季里。阿拉贡内斯将离开他执教成绩出色的马洛卡，转投在乙级联赛苦苦挣扎的马德里竞技。然后他用了一个赛季的时间，便将马德里竞技从乙级联赛的泥潭中拉了出来。
所以不可以怀疑他对马德里竞技的感情。
作为主教练，他先后四次执教马德里竞技。给马德里竞技带来了一个甲级联赛冠军，三个国王杯冠军。一个洲际杯，一个西班牙超级杯，一个伊比利亚杯（西班牙和葡萄牙两国当年最有代表性的球队的竞争），此外还有一个尚未诞生的乙级联赛冠军。
随后他辗转执教多家西班牙俱乐部。包括皇家贝蒂斯、巴塞罗那、西班牙人、塞维利亚、巴伦西亚、皇家奥维多、马洛卡……
目前他就执教于马洛卡。
本赛季，马洛卡在他的带领下最终排名联赛第三。力压巴塞罗那。
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