居间惠因为体内的3000万年前地球警备团团长幽怜的基因，而感知到了这三大黑暗巨人拥有毁灭地球的能力和邪恶，于是希望炸掉石像免除后患。
但却被阻止了。
这时，三大黑暗巨人复苏！
考察队除居间惠外无一生还！
三大黑暗巨人还释放出了他们饲养的魔鸟——小型佐加，企图让世界的天空再度笼罩在灭亡的黑暗中。
危急之时，居间惠体内的幽怜基因在遗迹的作用下苏醒，出手封印了遗迹，挡住了佐加们和三大黑暗巨人的去路。
另一方面，大古正在和丽娜一起旅行恋爱，他们即将步入婚姻的殿堂。
然而，在遗迹事件发生后，大古却经常会出现很离奇的梦和幻觉。
比如，大古带着丽娜，和野瑞以及新城的妹妹真由美一起去海洋馆游玩。
交谈时，大古说到自己正在发放婚礼请柬，却在耳边听到了卡蜜拉的声音，转头看到卡蜜拉笑着问他，为什么不给她也发一份请柬？
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