数千年前，大筒木一族降临火影世界，在地球种下神树。
在随后的时间里，神树不断成长的过程中，为了凝结查克拉果实，几乎吸干了地球上的生命能量，使得这颗星球大部分的地区都成了荒芜之地。
幸运的是,在世界的遥远边缘或隐秘角落，有一些地方躲过了神树的侵袭，至今仍留存着庞大的自然能量。
它们，就是所谓的三大圣地。
根据鬼鲛现在得到的情报，以及他的推测：
在三大圣地中，妙木山位于极西之地,从木叶出发需要一个月才能到达，是一片绵延的群山。
龙地洞则是大概率深藏于田之国的某处地下洞穴里，附近有一个村庄，生活着重吾一族。
原着中，重吾就是受到龙地洞泄露出来的自然能量影响，变得暴躁发狂。后来被大蛇丸发现，利用对重吾体质的研究，开发出了咒印。
至于最后的湿骨林，鬼鲛现在见到了，是位于极东之地的大海深处。
此外，在三大圣地，自然能量的存在形式也是截然不同的。
妙木山的自然能量，弥漫在群山之间的空气之中；龙地洞的自然能量，深藏于厚重的大地之下；而湿骨林的自然能量，则是蕴含在流动的海水里。
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